儀器在測量設備的過程中會遇到這樣那樣的問題，顆粒計數器使用也會遇見多種問題，常見的問題結如下：
1. 方法誤差
是指由于使用的測量方法不完善，理論依據不嚴密，對某些經典測量方法做了不適當的修改簡化所產生的誤差，即凡是在測量結果的表達式中沒有得到反映的因素，而實際上這些因素又起作用時所引起的誤差，我們又稱為理論誤差。比如：用普通萬用表測量電路中高阻值電阻兩端的電壓時，由于萬用表電壓擋內阻不高而形成分流，就會引起測量誤差。
2. 儀器，儀表誤差
由儀器，儀表本身及其附件所引入，出于儀器的電氣或機械性能不完善所產生的誤差。比如：電橋中的標準電阻，示波器的探極線等都含有誤差。儀器，儀表的零位偏移，刻度不準確，以及非線性等引起的誤差均屬于儀器誤差。
 3. 人身誤差
由于人的感覺器官和運動器官的限制所造成的誤差。對于某些需借助于人眼，人耳來判斷結果的測量，以及需進行人工調節等的測量工作，均會引入人身誤差。比如：讀錯刻度，念錯讀數等。
  4. 使用誤差
又稱為操作誤差，是指在使用儀器過程中，因安裝，調節，布置，使用不當而引起的誤差。比如：按規應垂直放置的儀表卻水平放置，儀器接地不良，因測試引線太長而造成損耗或未考慮阻抗匹配，未按操作規程在沒有預熱，調節，校正后就迸行測量等，都會產生使用誤差。
 5. 影響誤差
又稱為環境誤差，是指由于受到溫度，濕度，氣壓，電磁場，機械振動，聲音，光，放射性等影響所造成的附加誤差。